Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic1Q9DC16 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic1Q9DC16 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms