Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms