Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms