Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB27

Mcts1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcts1Q9DB27 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcts1Q9DB27 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms