Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn3Q9DAW9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms