Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms