Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Usp12Q9D9M2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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Usp12Q9D9M2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Usp12Q9D9M2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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