Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4bQ9D9F7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Speer4bQ9D9F7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms