Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D9D9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D9D9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D9D9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms