Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2e2Q9D902 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e2Q9D902 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms