Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms