Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8N1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8N1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8N1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8N1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8N1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8N1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms