Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmigd1Q9D7L8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms