Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Capns2Q9D7J7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capns2Q9D7J7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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