Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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