Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms