Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms