Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc81Q9D5W4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms