Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930449I24RikQ9D5E3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms