Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a3Q9D554 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms