Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms