Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clvs1Q9D4C9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms