Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933428M09RikQ9D3X3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms