Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpn3Q9D3W4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpn3Q9D3W4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms