Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy3Q9D394 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms