Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms