Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsig1Q9D2J4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsig1Q9D2J4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsig1Q9D2J4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms