Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trappc6bQ9D289 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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