Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D1K7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms