Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab1bQ9D1G1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab1bQ9D1G1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms