Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snu13Q9D0T1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snu13Q9D0T1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snu13Q9D0T1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snu13Q9D0T1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms