Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stx17Q9D0I4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx17Q9D0I4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms