Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pbdc1Q9D0B6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms