Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms