Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp3Q9D032 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp3Q9D032 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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