Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610524H06RikQ9CZU9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610524H06RikQ9CZU9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms