Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shmt2Q9CZN7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms