Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc77Q9CZH8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc77Q9CZH8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms