Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110001I22RikQ9CZ70 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms