Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Prdm5Q9CXE0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Prdm5Q9CXE0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Prdm5Q9CXE0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Prdm5Q9CXE0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Prdm5Q9CXE0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Prdm5Q9CXE0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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