Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkrip1Q9CWV6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms