Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms