Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda2Q9CRC9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda2Q9CRC9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda2Q9CRC9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda2Q9CRC9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda2Q9CRC9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda2Q9CRC9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda2Q9CRC9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms