Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NmbQ9CR53 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms