Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms