Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifitm3Q9CQW9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm3Q9CQW9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms