Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc2Q9CQP2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms