Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdm1Q9CQK3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms