Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DenrQ9CQJ6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DenrQ9CQJ6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms