Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms